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アイテム
Secondary structure breakers and hairpin structures in myoglobin and hemoglobin
http://hdl.handle.net/2237/9271
http://hdl.handle.net/2237/92713ce19fad-e8be-4445-997e-e575c8b10b2d
| 名前 / ファイル | ライセンス | アクション |
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5_65-J.pdf (142.0 kB)
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5_65-E.pdf (491.1 kB)
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| Item type | 学術雑誌論文 / Journal Article(1) | |||||
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| 公開日 | 2008-01-11 | |||||
| タイトル | ||||||
| タイトル | Secondary structure breakers and hairpin structures in myoglobin and hemoglobin | |||||
| 言語 | en | |||||
| その他のタイトル | ||||||
| その他のタイトル | ミオグロビン、ヘモグロビンにおける二次構造ブレイカとヘアピン構造のメカニズム | |||||
| 言語 | ja | |||||
| 著者 |
Imai, Kenichiro
× Imai, Kenichiro× 今井, 賢一郎× Asakawa, Naoyuki× 朝川, 直行× Tsuji, Toshiyuki× 辻, 敏之× Sonoyama, Masashi× 園山, 正史× Mitaku, Shigeki× 美宅, 成樹 |
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| アクセス権 | ||||||
| アクセス権 | open access | |||||
| アクセス権URI | http://purl.org/coar/access_right/c_abf2 | |||||
| キーワード | ||||||
| 主題Scheme | Other | |||||
| 主題 | secondary structure | |||||
| キーワード | ||||||
| 主題Scheme | Other | |||||
| 主題 | all-α protein | |||||
| キーワード | ||||||
| 主題Scheme | Other | |||||
| 主題 | charge symmetry | |||||
| キーワード | ||||||
| 主題Scheme | Other | |||||
| 主題 | prediction | |||||
| キーワード | ||||||
| 主題Scheme | Other | |||||
| 主題 | bioinformatics | |||||
| キーワード | ||||||
| 主題Scheme | Other | |||||
| 主題 | 二次構造 | |||||
| キーワード | ||||||
| 主題Scheme | Other | |||||
| 主題 | 二次構造ブレイカ | |||||
| キーワード | ||||||
| 主題Scheme | Other | |||||
| 主題 | 水溶性タンパク質 | |||||
| キーワード | ||||||
| 主題Scheme | Other | |||||
| 主題 | 両親媒性 | |||||
| キーワード | ||||||
| 主題Scheme | Other | |||||
| 主題 | 電荷分布 | |||||
| キーワード | ||||||
| 主題Scheme | Other | |||||
| 主題 | 構造予測 | |||||
| 抄録 | ||||||
| 内容記述タイプ | Abstract | |||||
| 内容記述 | Secondary structure breakers, particularly hairpin structures, impose strong limitations on the global structure of a protein. Three kinds of secondary structure breakers (proline, glycine and amphiphilic residues) were studied in myoglobin and hemoglobin, which are typical all-α type proteins. Secondary structure breakers were located as predicted in about two thirds of the interhelical loops. Charge symmetry analysis provided evidence that high charge symmetry drives the formation of hairpin structures. Based on this information about breakers and hairpin structures, the possibility of folding a protein in silico is discussed. | |||||
| 言語 | en | |||||
| 抄録 | ||||||
| 内容記述タイプ | Abstract | |||||
| 内容記述 | 二次構造ブレイカやヘアピン構造形成は、タンパク質の構造形成に対して強い制限を与える。 そこで、典型的なall-α型のタンパク質であるミオグロビン、ヘモグロビンに注目し、二次構造ブレイカとヘアピン構造のメカニズムについて解析を行った。 以前の研究で、我々は、二次構造ブレイカにはプロリン、グリシン、両親媒性残基の3種類があることを示した。 これら3種の二次構造ブレイカを予測する方法でミオグロビン、ヘモグロビンのアミノ酸配列を解析したところ、ループ構造の7本中5本がこれらのブレイカによって折りたたまれていることがわかった。 さらに電荷分布の対称性を調べたところ、電荷分布の対称性とヘアピン構造には高い相関があることが見出され、電荷分布の対称性がヘアピン構造形成の駆動力になっていることが示唆された。 これらのことから電荷の対称性と二次構造ブレイカに注目することで、ミオグロビン、ヘモグロビンのすべてのループの折りたたみをとらえることができた。 | |||||
| 言語 | ja | |||||
| 出版者 | ||||||
| 出版者 | Chem-Bio Informatics Society | |||||
| 言語 | en | |||||
| 言語 | ||||||
| 言語 | eng | |||||
| 資源タイプ | ||||||
| 資源タイプ識別子 | http://purl.org/coar/resource_type/c_6501 | |||||
| 資源タイプ | journal article | |||||
| 出版タイプ | ||||||
| 出版タイプ | VoR | |||||
| 出版タイプResource | http://purl.org/coar/version/c_970fb48d4fbd8a85 | |||||
| 関連情報 | ||||||
| 関連タイプ | isVersionOf | |||||
| 識別子タイプ | URI | |||||
| 関連識別子 | http://www.cbi.or.jp/cbi/CBIj/vol5/5_65-J.pdf | |||||
| 関連情報 | ||||||
| 関連タイプ | isVersionOf | |||||
| 識別子タイプ | URI | |||||
| 関連識別子 | http://www.cbi.or.jp/cbi/CBIj/vol5/5_65-E.pdf | |||||
| ISSN | ||||||
| 収録物識別子タイプ | PISSN | |||||
| 収録物識別子 | 1347-6297 | |||||
| 書誌情報 |
en : Chem-Bio Informatics Journal 巻 5, 号 3, p. 65-77, 発行日 2005 |
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| フォーマット | ||||||
| 値 | application/pdf | |||||
| 著者版フラグ | ||||||
| 値 | publisher | |||||
| URI | ||||||
| 識別子 | http://hdl.handle.net/2237/9271 | |||||
| 識別子タイプ | HDL | |||||
