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  1. B200 工学部/工学研究科
  2. B200a 雑誌掲載論文
  3. 学術雑誌

Secondary structure breakers and hairpin structures in myoglobin and hemoglobin

http://hdl.handle.net/2237/9271
http://hdl.handle.net/2237/9271
3ce19fad-e8be-4445-997e-e575c8b10b2d
名前 / ファイル ライセンス アクション
5_65-J.pdf 5_65-J.pdf (142.0 kB)
5_65-E.pdf 5_65-E.pdf (491.1 kB)
Item type 学術雑誌論文 / Journal Article(1)
公開日 2008-01-11
タイトル
タイトル Secondary structure breakers and hairpin structures in myoglobin and hemoglobin
言語 en
その他のタイトル
その他のタイトル ミオグロビン、ヘモグロビンにおける二次構造ブレイカとヘアピン構造のメカニズム
言語 ja
著者 Imai, Kenichiro

× Imai, Kenichiro

WEKO 21340

en Imai, Kenichiro

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今井, 賢一郎

× 今井, 賢一郎

WEKO 21341

ja 今井, 賢一郎

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Asakawa, Naoyuki

× Asakawa, Naoyuki

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en Asakawa, Naoyuki

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朝川, 直行

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ja 朝川, 直行

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Tsuji, Toshiyuki

× Tsuji, Toshiyuki

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en Tsuji, Toshiyuki

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辻, 敏之

× 辻, 敏之

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ja 辻, 敏之

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Sonoyama, Masashi

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en Sonoyama, Masashi

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園山, 正史

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ja 園山, 正史

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Mitaku, Shigeki

× Mitaku, Shigeki

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美宅, 成樹

× 美宅, 成樹

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ja 美宅, 成樹

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アクセス権
アクセス権 open access
アクセス権URI http://purl.org/coar/access_right/c_abf2
キーワード
主題Scheme Other
主題 secondary structure
キーワード
主題Scheme Other
主題 all-α protein
キーワード
主題Scheme Other
主題 charge symmetry
キーワード
主題Scheme Other
主題 prediction
キーワード
主題Scheme Other
主題 bioinformatics
キーワード
主題Scheme Other
主題 二次構造
キーワード
主題Scheme Other
主題 二次構造ブレイカ
キーワード
主題Scheme Other
主題 水溶性タンパク質
キーワード
主題Scheme Other
主題 両親媒性
キーワード
主題Scheme Other
主題 電荷分布
キーワード
主題Scheme Other
主題 構造予測
抄録
内容記述 Secondary structure breakers, particularly hairpin structures, impose strong limitations on the global structure of a protein. Three kinds of secondary structure breakers (proline, glycine and amphiphilic residues) were studied in myoglobin and hemoglobin, which are typical all-α type proteins. Secondary structure breakers were located as predicted in about two thirds of the interhelical loops. Charge symmetry analysis provided evidence that high charge symmetry drives the formation of hairpin structures. Based on this information about breakers and hairpin structures, the possibility of folding a protein in silico is discussed.
言語 en
内容記述タイプ Abstract
抄録
内容記述 二次構造ブレイカやヘアピン構造形成は、タンパク質の構造形成に対して強い制限を与える。 そこで、典型的なall-α型のタンパク質であるミオグロビン、ヘモグロビンに注目し、二次構造ブレイカとヘアピン構造のメカニズムについて解析を行った。 以前の研究で、我々は、二次構造ブレイカにはプロリン、グリシン、両親媒性残基の3種類があることを示した。 これら3種の二次構造ブレイカを予測する方法でミオグロビン、ヘモグロビンのアミノ酸配列を解析したところ、ループ構造の7本中5本がこれらのブレイカによって折りたたまれていることがわかった。 さらに電荷分布の対称性を調べたところ、電荷分布の対称性とヘアピン構造には高い相関があることが見出され、電荷分布の対称性がヘアピン構造形成の駆動力になっていることが示唆された。 これらのことから電荷の対称性と二次構造ブレイカに注目することで、ミオグロビン、ヘモグロビンのすべてのループの折りたたみをとらえることができた。
言語 ja
内容記述タイプ Abstract
出版者
言語 en
出版者 Chem-Bio Informatics Society
言語
言語 eng
資源タイプ
資源タイプresource http://purl.org/coar/resource_type/c_6501
タイプ journal article
出版タイプ
出版タイプ VoR
出版タイプResource http://purl.org/coar/version/c_970fb48d4fbd8a85
関連情報
関連タイプ isVersionOf
識別子タイプ URI
関連識別子 http://www.cbi.or.jp/cbi/CBIj/vol5/5_65-J.pdf
関連情報
関連タイプ isVersionOf
識別子タイプ URI
関連識別子 http://www.cbi.or.jp/cbi/CBIj/vol5/5_65-E.pdf
ISSN
収録物識別子タイプ PISSN
収録物識別子 1347-6297
書誌情報 en : Chem-Bio Informatics Journal

巻 5, 号 3, p. 65-77, 発行日 2005
フォーマット
application/pdf
著者版フラグ
値 publisher
URI
識別子 http://hdl.handle.net/2237/9271
識別子タイプ HDL
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Ver.1 2021-03-01 12:18:04.073200
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